Je comprends.
I understand YOU: Je vous comprends. (formal) / Je te comprends (informal)
I understand IT: Je le comprends.
I understand that: also Je le comprends
I understand what you're saying: Je comprends ce que vous dites (formal) / Je comprends ce que tu dis (informal)
I understand her/him: Je la comprends (her) / Je le comprends (him)
I understand French: Je comprends français (anglais english)